Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhodP97348 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhodP97348 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhodP97348 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhodP97348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhodP97348 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhodP97348 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhodP97348 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhodP97348 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhodP97348 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhodP97348 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhodP97348 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhodP97348 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhodP97348 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhodP97348 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhodP97348 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhodP97348 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhodP97348 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhodP97348 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhodP97348 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhodP97348 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhodP97348 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhodP97348 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhodP97348 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhodP97348 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhodP97348 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RhodP97348 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms