Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeboxP70368 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeboxP70368 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SeboxP70368 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms