Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4fP70194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4fP70194 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms