Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig1P70193 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms