Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp3caP63328 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3caP63328 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3caP63328 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms