Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uba52P62984 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uba52P62984 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uba52P62984 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uba52P62984 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uba52P62984 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uba52P62984 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms