Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx1P62960 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx1P62960 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx1P62960 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms