Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2P62838 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2P62838 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms