Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gabra1P62812 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms