Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc6P62334 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc6P62334 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc6P62334 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc6P62334 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms