Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd3P62320 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms