Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psmc5P62196 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmc5P62196 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms