Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc1P62192 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc1P62192 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc1P62192 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms