Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp46P62069 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp46P62069 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms