Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufm1P61961 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufm1P61961 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms