Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfia3P60469 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia3P60469 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia3P60469 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms