Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paxbp1P58501 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paxbp1P58501 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paxbp1P58501 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paxbp1P58501 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms