Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp1P58466 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms