Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dpf3P58269 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dpf3P58269 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dpf3P58269 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms