Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp4P57724 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp4P57724 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp4P57724 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms