Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmoP56726 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmoP56726 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmoP56726 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmoP56726 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmoP56726 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmoP56726 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SmoP56726 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SmoP56726 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SmoP56726 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmoP56726 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SmoP56726 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmoP56726 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SmoP56726 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmoP56726 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmoP56726 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmoP56726 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmoP56726 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmoP56726 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmoP56726 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmoP56726 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmoP56726 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmoP56726 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmoP56726 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmoP56726 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmoP56726 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmoP56726 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmoP56726 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmoP56726 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SmoP56726 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmoP56726 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmoP56726 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmoP56726 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SmoP56726 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmoP56726 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SmoP56726 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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