Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lim2P56563 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms