Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gp1bbP56400 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms