Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb3P54754 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb3P54754 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms