Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx4P53776 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx4P53776 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx4P53776 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms