Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2e3P52483 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms