Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1cP52432 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1cP52432 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1cP52432 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms