Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClgnP52194 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms