Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApodP51910 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApodP51910 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApodP51910 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ApodP51910 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApodP51910 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApodP51910 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApodP51910 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApodP51910 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApodP51910 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ApodP51910 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApodP51910 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApodP51910 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApodP51910 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApodP51910 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApodP51910 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApodP51910 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApodP51910 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApodP51910 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApodP51910 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ApodP51910 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ApodP51910 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ApodP51910 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApodP51910 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApodP51910 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApodP51910 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApodP51910 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApodP51910 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApodP51910 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApodP51910 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms