Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec1P51908 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec1P51908 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms