Protein–RNA interactions for Protein: P50431

Shmt1, Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt1P50431 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt1P50431 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shmt1P50431 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms