Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpbP50405 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpbP50405 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpbP50405 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpbP50405 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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