Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc13P50207 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc13P50207 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms