Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtshP49935 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtshP49935 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtshP49935 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtshP49935 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtshP49935 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtshP49935 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtshP49935 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtshP49935 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtshP49935 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtshP49935 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CtshP49935 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtshP49935 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtshP49935 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtshP49935 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtshP49935 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CtshP49935 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtshP49935 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtshP49935 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtshP49935 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtshP49935 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtshP49935 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtshP49935 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtshP49935 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtshP49935 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtshP49935 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtshP49935 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtshP49935 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtshP49935 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CtshP49935 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtshP49935 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtshP49935 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtshP49935 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtshP49935 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtshP49935 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtshP49935 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtshP49935 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtshP49935 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CtshP49935 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtshP49935 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtshP49935 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtshP49935 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtshP49935 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtshP49935 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CtshP49935 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtshP49935 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtshP49935 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtshP49935 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CtshP49935 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtshP49935 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtshP49935 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtshP49935 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtshP49935 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms