Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh1P48985 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh1P48985 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms