Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PcntP48725 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PcntP48725 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcntP48725 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcntP48725 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcntP48725 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcntP48725 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcntP48725 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PcntP48725 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcntP48725 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcntP48725 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcntP48725 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcntP48725 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcntP48725 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PcntP48725 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PcntP48725 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PcntP48725 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PcntP48725 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcntP48725 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PcntP48725 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcntP48725 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcntP48725 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcntP48725 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcntP48725 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcntP48725 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcntP48725 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcntP48725 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcntP48725 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcntP48725 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcntP48725 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcntP48725 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcntP48725 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PcntP48725 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcntP48725 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcntP48725 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcntP48725 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcntP48725 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms