Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LmnaP48678 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LmnaP48678 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LmnaP48678 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LmnaP48678 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms