Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CratP47934 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CratP47934 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CratP47934 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CratP47934 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CratP47934 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CratP47934 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CratP47934 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CratP47934 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CratP47934 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CratP47934 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CratP47934 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CratP47934 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CratP47934 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CratP47934 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CratP47934 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CratP47934 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CratP47934 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms