Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Igfbp6P47880 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igfbp6P47880 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp6P47880 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms