Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfkmP47857 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfkmP47857 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfkmP47857 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfkmP47857 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PfkmP47857 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PfkmP47857 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms