Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr7P47774 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr7P47774 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr7P47774 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr7P47774 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr7P47774 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr7P47774 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr7P47774 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr7P47774 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr7P47774 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr7P47774 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr7P47774 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms