Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp2P46686 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tulp2P46686 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tulp2P46686 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tulp2P46686 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms