Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf1P46099 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf1P46099 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf1P46099 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf1P46099 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf1P46099 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms