Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad52P43352 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad52P43352 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad52P43352 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad52P43352 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rad52P43352 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad52P43352 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms