Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf6P43028 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf6P43028 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf6P43028 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms