Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3caP42337 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3caP42337 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms