Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elk3P41971 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elk3P41971 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Elk3P41971 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Elk3P41971 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Elk3P41971 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Elk3P41971 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms