Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc19a1P41438 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc19a1P41438 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms