Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CskP41241 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CskP41241 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CskP41241 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CskP41241 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CskP41241 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CskP41241 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CskP41241 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CskP41241 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CskP41241 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CskP41241 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CskP41241 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CskP41241 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CskP41241 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CskP41241 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CskP41241 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CskP41241 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CskP41241 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CskP41241 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CskP41241 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CskP41241 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CskP41241 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CskP41241 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CskP41241 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CskP41241 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CskP41241 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CskP41241 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CskP41241 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CskP41241 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CskP41241 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CskP41241 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CskP41241 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CskP41241 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CskP41241 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CskP41241 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CskP41241 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CskP41241 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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