Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ThpoP40226 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ThpoP40226 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ThpoP40226 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms